Pandemi Covid 19 yang melanda dunia, mulai terasa dampaknya pada UPTD Puskesmas Manyaran sejak bulan Maret tahun 2020. Sepanjang tahun 2020, Puskesmas Manyaran telah melakukan pendampingan pada 630 pasien Covid-19 dengan 31 pasien meninggal. Dengan pertambahan pasien yang cukup pesat, maka Puskesmas Manyaran mulai mengalami kendala dalam pendampingan pasien Covid selama masa isolasi. Oleh karenanya Puskesmas Manyaran mencetuskan SIPANTAU (Sistem Pemantauan Covid).